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乡镇、县医院污水中通常含有多种细菌、病毒、寄生虫卵和一些有毒、有害物质。这些细菌病毒和寄生虫卵在环境中具有较强的抵抗力，在污水中存活时间较长。当人们食用或接触被细菌、病毒、寄生虫卵或有毒、有害物质污染的水和蔬菜时，就会使人致病，甚至引起传染病的爆发流行。历史上曾对医院污水危害的认识不够，医院污水未经处理任意排放，引起多起传染病流行事件，给人们的健康带来巨大危害。同时，医院污水中还含有重金属、消毒剂、有机溶剂以及酸、碱、放射性物质等，是致癌、致畸、致突变物质，这些物质排入水体将对环境造成巨大的危害并长期危害人体健康。
排放标准：
《医疗机构水污染物排放标准》（GB18466-2005）
《污水综合排放标准》（GB8978-1996）
《污水排入下水道水质标准》（GB/T31962-2015）
医疗机构污水处理的程度，主要是根据污水的排向而定，本着安全、环保、节能、减排、增效的基本原则，选择技术前瞻、工艺可靠、工程投资经济、处理效果稳定、处理流程简化、运转费用经济、操作管理简单的污水处理工艺。
